1. 좌표 시스템의 기본 구성 의료영상을 다루는 시스템 별로 주요 적으로 활용하는 이미지 평면의 기준 좌표를 정리한다. 좌표계는 CT, MRI 의 장비 기준의 좌표계, 해부학적인 좌표계, 그리고 이미지 좌표계로 구분할 수 있다. 우선 의료 영상 분석을 위해서는 CT, MRI 장비를 촬영할 것이고 DICOM 의료영상 데이터로 저장하게 된다. 촬영된 영상데이터는 아래와 같이 환자의 입장에서 바라보는 것이 아니라 거울에 비춰진 것 처럼 좌우가 반대되어 바라보는 위치에서 영상을 마주하게 된다. 참고로 의료영상에서 보편적인것이 DICOM 이기는 하지만 최근 NIfTI format 의 영상도 많이 사용되는 것 같다. 두개의 데이터는 크게 다르지 않으나 생겨난 목적과 작은 차이가 있다. DICOM ( Digital ..
1. Hounsfield Unit 의료 영상에서 Pixel 에 사용되는 값의 단위는 HU 라고 하였습니다. CT는 발광부에서 X-ray를 쏘고, 이를 물체에 투과하였을 때 물체가 얼마나 X-ray를 흡수하는지를 나타내는 값입니다. 물을 0 HU, 공기를 -1000HU 로 기준으로 합니다. 그리고 인체의 각 부위별로 나타내는 값이 다음과 같습니다. 이 값은 절대적인 값은 아니지만 일반적으로 나타내는 값입니다. 2. Window Level, Window Width 우리가 HU 영상을 Gray 영상으로 변환하였을 때에 전체 값을 맵핑할 경우 우리가 원하는 부위의 영상을 알아보기가 어렵습니다. 그래서 사용하는 것이 영상의 Window Level과 Width 를 적용하여 맵핑하도록 합니다. Window Level..
CT 의료 영상은 grayscale의 Hounsfield Unit (HU) 을 사용합니다. 값은 12bit 이며 -1024 ~ 3071 값의 범위를 갖습니다. Dicom TAG를 보면 2byte 메모리에서 12bits 데이터를 값으로 사용함을 알수 있습니다. Dicom 파일을 vtk 를 이용해서 이미지를 표시하면 다음과 같은 영상을 출력합니다. 보면, 그동안 보았던 영상과는 좀 다르게 보입니다. 이유는 12bit 영상을 8bit 영상으로 표현해서 그렸기 때문입니다. 이와 같이 CT영상은 우리가 영상처리에서 사용하는 값의 범위가 아닌 HU 단위의 값을 갖고 있기 떄문에 HU를 Gray pixel 값으로 변환하는 작업이 필요합니다. HU의 영역 값으로 변환할 때에는 Window width / level의 개..
